Tesis de maestría · Universidad Nacional de Colombia
Análisis genómico y reconstrucción metabólica de la papa criolla Colombia
Una tesis de maestría sobre el ensamblaje y la anotación del genoma de la variedad Colombia de papa criolla y la reconstrucción de un modelo metabólico.
Del dato a la interpretación
El resumen institucional documenta un flujo de secuenciación, ensamblaje, evaluación, anotación y reconstrucción metabólica.
01 PacBio HiFi
Lecturas largas y de alta precisión: el material de partida del ensamblaje.
02 Ensamblaje y evaluación
Las lecturas que se solapan se unen en secuencias continuas; el ensamblaje se corrige, se andamia y se evalúa su calidad.
03 Anotación
Sobre la secuencia ensamblada se predicen los genes y se les asigna una función.
04 Reconstrucción metabólica
Los genes anotados se traducen en reacciones que forman un modelo metabólico a escala genómica.
Contexto
El cultivar «Criolla Colombia» de Solanum tuberosum L. Grupo Phureja motiva la construcción de recursos genómicos para estudiar su biología. La tesis depositada en el repositorio de la Universidad Nacional de Colombia presenta un ensamblaje genómico y un modelo metabólico a escala genómica.
Del dato al modelo
Según el resumen institucional, el trabajo parte de lecturas PacBio HiFi; continúa con corrección y evaluación del ensamblaje, andamiaje, predicción y anotación génica, y reconstrucción de un modelo metabólico. La tesis describe las herramientas, parámetros y resultados de cada etapa; este sitio no reemplaza esa documentación.
Fuente
Consultar la tesis completa en el repositorio institucional. Cualquier cifra o conclusión científica debe leerse junto con la metodología y las limitaciones de esa fuente primaria.